1995年国家教委委托学位与研究生教育评估所对全国33所大学研究生院的评估结果:
排名前十的高校名单：清华大学、北京大学、南京大学、复旦大学、西安交通大学、浙江大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、华中理工大学（现华中科技大学）、 中国科技大学
1996年前十名高校名单：清华大学、南京大学、北京大学、浙江大学、西安交通大学、复旦大学、华中理工大学（现华中科技大学）、哈尔滨工业大学、东南大学、中国科技大学
1997年前十名高校名单：清华大学、南京大学、北京大学、浙江大学、复旦大学、东南大学、华中理工大学（现华中科技大学）、西安交通大学、中国科技大学、哈尔滨工业大学
可以看出：最初排名时（95、96年）还没有掺杂经济色彩，96年以后武书连的排名起到了一定的作用，一些思想活头脑灵的校长认识到大学排名的重要性，积极研究对策来提升自己大学的排名包括：如何利用排名计算方法提高排名（学校合并、不择手段发表论文等）、如何影响武书连的排名（经济手段） 因此，可以说，98年以后的大学排名就没有什么意义了，大学还是那个大学，变化的只是武大郎的排名。我们知道，影响一个大学质量的重要因素是教育设施，其次是学生质量，大学老师相对来说并不重要。可以说：大学的好坏并不是10年8年能改变的，变化的只是学生的质量。武大郎的排名之所以不断的变化，原因很清楚。再强调一点：96年以前的排名比较准确，以后的都掺杂了水分。另一点国家确定为建设世界一流大学的C9大学将是我国最好大学的不二人选。
武书连从1997年开始了他的肮脏的大学排名交易，请看他是如何一步步的将有些大学排到前面的：
2000年全国高校大合并之后的排名:
2001年前十名高校名单：清华大学、浙江大学、北京大学、南京大学、华中理工大学、上海交通大学、复旦大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学、东南大学
2002年前十名高校名单：清华大学、北京大学、浙江大学、复旦大学、南京大学、华中科技大学、武汉大学、西安交通大学、吉林大学、上海交通大学