苹果套袋后，果实需要继续积蓄营养，准备第二次膨大，果内种子开始形成并逐步成熟，需要大量且全面的营养物质和光合产物。同时，由于树上新梢基本停长，苹果树跨入第二次新根发育高峰期，对营养的吸收进入一年中最旺盛的时期。这时，采取根部施肥，主要以氮、磷、 钾为主，在施肥中要注意偏重磷、钾肥的施用。要根据树势的强弱、负载量的大小，每亩分别施用肥料： 钙立方40kg、13-12-18复合肥40-120 kg、15-5-25冲施肥10-20kg追肥。采用开放射状浅沟或按树冠外围开圆浅沟，撒施，培土后及时浇水。为满足苹果树对中微量元素的需求，尤其是负载量较大的果园，要喷3遍五洲丰叶面肥，促使产出果大、表面光亮、颜色红、风味好的优质果。
到了九月中旬至十月份，是苹果秋季施肥的最佳时间。第一，根据树龄大小，树势强弱、 负载量大小等不同情况，建议每亩用五洲丰有机菌肥6-8 袋，用五洲丰复合肥2-3 袋。第二，施肥时注意：适当深开沟。施用复合肥时，不要太集中，应撒开施用，并用土拌匀;施肥时要避免破坏树根，施肥后应及时复土浇水，保证肥效的及时发挥。第三，施肥前，最好测量一下土壤的PH 值，对于土壤酸化的地块要首先使用酸土改良剂。必要时选用五洲丰钙立方3-5袋平衡土壤酸碱。