将设置——图形——渲染器 中的内部分辨率设置为原生即可立刻提升速度，在默认配置下速度只有25%，改完之后立刻提升到80%左右。已经达到可以玩的水平了。
测试版本为2018/05/31日的官方Canary。硬件环境为i5-6300HQ GTX1060 Win10。
此解决方案来自Reddit
顺便说一下，字幕文件要放到 C:\Users\你的用户名\AppData\Roaming\Citra\sdmc\ 下面。