影响鸡群肠道的因素
饲料与管理因素
使用了劣质饲料，除了营养不均衡和吸收率差外，其中的粗纤维含量可能也会超标。也有的因为添加了劣质原料，破坏了肠道内环境，损伤肠粘膜乃至发病。饮用了污浊的水源，会破坏鸡的肠道内环境，进而发生细菌或功能性腹泻，就会引起鸡的肠粘膜损伤，出现应激性腹泻。环境卫生差，都很容易诱发肠道疾病。
疾病因素
（1）肠道菌群失调。肠道菌群失调，临床上主要表现“料粪”（粪便中出现未被消化的饲料）；饮水量增加。发生菌群失调时，用微生态制剂调理，勿用抗生素（产蛋期禁用抗生素）不然会适得其反。
（2）病毒性因素。病毒性肠炎，多与轮状病毒和呼肠孤病毒有关。
（3）球虫病。在整个养殖过程中，球虫病一直是最普遍的影响肠道健康和生长效率的重要疾病之一，而感染球虫后所引发的肠道病原菌感染，也是引发肠道疾病的重要原因。
（4）坏死性肠炎。引起坏死性肠炎的因素很多，但产气荚膜梭状芽孢杆菌是导致坏死性肠炎的一种普遍存在的厌氧性微生物。
（5）霉菌毒素蓄积性中毒。霉菌毒素正在逐步加重对我国的威胁。霉菌的污染，一般多见饲料、环境的污染。饲料污染最常见的是玉米的污染，其次是豆粕、杂粕的污染，然后是食槽内的污染和成品料的污染。霉菌及其毒素的污染，对鸡的各个系统各个组织都能造成损害，尤其是消化系统。如肌胃溃烂、腺胃肿大、肠粘膜脱落、肠道菌群失调等；临床表现就是拉稀、拉不消化饲料粪便。我国养鸡行业中流行的腺胃炎、肌胃腺胃炎，基本上都是由目前霉菌及其毒素引起的。但是，由于饲料霉变因素无法彻底排除，因而商品肉鸡要经常面临肠道不健康，消化系统功能不全的现状。
使鸡拥有健康肠道的关键措施
1.确保良好的种鸡营养，有助于提高雏鸡的初生重和整齐度；
2.缩小雏鸡运输时间，避免运输过程的热应激或冷应激；
3.提供良好的育雏条件和高质量的育雏料；
4.避免使用低劣的油脂和高纤维植物蛋白原料，确保雏鸡阶段就拥有健康的肠道。提供优质的饲料，其中所含的各种营养成分均衡，容易被消化吸收；保障机体健康。选择优良水源，供给清洁饮水；
5.遵循循序渐进的换料方式，杜绝换料应激；
6.加强环境卫生消毒，保护好呼吸道，防止机体防御体系的第一道门户受损。
7.使用活菌发酵中药产品牧平不仅可以调节肠道增强机体免疫能力还可以预防和辅助治疗肠道疾病、预防为主、防治结合。