其实不然，真正的原因是“少女心里已有了别人”，三重真正爱的人是伊良子青玄：得知虎眼父亲宣布让伊良子继承，她就满心欢喜期待；观察他每天练习完毕后就休息说他偷懒；伊良子送黑烧，三重在背后有机会杀他以报杀父之仇，却最终没有动手。等等都可以看出三重爱的人是他。
至于藤木的傀儡之说，我不赞同，他不是傀儡，只是为了报恩，守护虎眼流。最后的割头屈从，也是为了守护三重，因为她是唯一残存于世间的虎眼流，是让他受尽屈辱而绝不切腹，活下去的理由。所以最后三重自杀，藤木八成也会自杀，只是作者没有画出来。

如果三重会为了藤木而绝望
那她最开始为啥在幻觉中看见藤木死于无明逆流？

大体同意楼主说法！对三重来说，以前的藤木是武士道的傀儡（干涸的海螺）。断手后的藤木学会了反抗武士道（为了取胜和蜂打不杀对决扔武士刀）（海螺渐渐被海水湿润），三重以为藤木已经变成了个真正的人。藤木对决伊良子清玄取胜后，忠长让藤木取尸体首级，三重意识到藤木依然是武士道的傀儡，于是绝望，自杀。（海螺重新干涸）

三重是一个非常矛盾的人。生在那个时代向往自由、她一方面羡慕爱恋伊良子的自由，缺又无法抛弃那个时代的传统观念而选择彻底离开藤木。所以她只能自杀

三重其实有很短暂的爱过藤木，但远不及对12子的，她和12子都是占在时代的对立面。三重的三重，是代表了三重人格，对12子的，对虎眼的，对藤木的。
虎眼在世的事后，三重一开始就被有意培养成生育工具（斩杀燕子、查看发育情况），虎眼对仕途的遗憾但因无法回头，全部希望就寄托给更强的下一代，不在乎是谁，只要是强者就行（所以问牛股谁12子和藤木谁更适合当继承人），虎眼还念道“如果是男孩的话”，一切都只是为了他的遗憾。
在后面经历神志不清的虎眼当众让她行房，作为大小姐的尊严，还没说几句话就被拦住，切开衣服露出私处、被众人按压在地板上，成为如牲畜般低贱的工具，此时此刻她对父亲、周围的徒弟、藤木、乃至于整个武士道的社会状况都是绝望到了顶点，直到12子敢站出来反抗，这是她从小到大第一次看见有人能够对抗这种愚昧武士道的人，和从小被拿铁筷子忍住不放手的藤木傀儡脸相比，她看到一个如此保护自己自尊的男人，如同救世主。哪怕是后面处决12子事前，她还满怀期待准备迎接如意郎君的归来，觉得自己不会像母亲那样上吊而亡。
处决12子后，她不吃不喝，失魂落魄，连性幻想都是和12子，也是受父亲强制喂食和12子通奸的双重打击，选择出逃，在这个事情中，是以藤木在三重挥刀，两者同时飞出，藤木毫不犹豫选择保护刀时结束，她眼中已经看清藤木对自己的感情不如一把刀，绝望地站着不动。后面摸刀对藤木笑，意识到12子活着并且回来复仇了，她眼中是充满希望的笑了。
12子VS虎眼那一天，她身着白无垢，是第一次和12子重逢，虽然他是个瞎子，但这就是给虎眼看的，让他知道自己是选择了那个能反抗你，被你逐出师门的12子，绝不听再听虎眼的摆布，就是要气煞你干扰你，一种叛逆的复仇之心，此时此刻三重和12子一直都是同路人，直到后面虎眼半边脑浆流出来，这一刻对虎眼充满恨意的三重晕倒后也一起死了，剩下的就是那个为父报仇的三重。
一直到后面12子VS藤木，期间对12子洗白的情节太多，甚至有机会三重也没动手。藤木这边在没有虎眼的情况下，也慢慢开始委婉的对三重表达倾诉，一直是默默保护的他，在无限的给三重安全感，这种稳定平淡且美好的日子，是三重暂时的庇护所，让她重新对未来的生活充满憧憬。决战前她看见藤木被切开头，这里其实非常开放，弗洛伊德说过梦就是欲望的表达，三重所见，一方面是她自身的期待，另一方面是她作为虎眼流未来的担忧。最终她其实还是选择的大局，尽到了一个武家之女的责任，此刻她最后一根弦就是和藤木开创新的虎眼流。直到最后傀儡藤木重来，12子面目全非身首异处，三重的三个对应的人格全部死亡，她眼中只剩下对藤木的失望和对时代的绝望，幻想破灭，虎眼虽死但这种被控制被压迫的生活，她无法再逃离，只能选择自杀，不是为了12子，也不是为了藤木或虎眼，而是为了这个时代。

没有三重介入，伊良子早死在虎眼手下，所以三重是爱伊良子的。

刚看完，和楼主观点一样

三重这个货压根就没喜欢过藤木，就是个绿茶。她喜欢的一直是清玄，藤木只是她复仇的工具人罢了。这漫画里最惨的就是藤木。清玄在藤木面前，毫无忠义可言。而忠义这个东西，是作为一名武士所必须的。你可以说清玄天赋异禀，魅力无穷，勾搭女人天下无双，但是在真正的武士面前，他这些东西都是浮云。所以这也是为什么后来藤木输给清玄两次之后，还能击杀清玄。

斩下伊良子的头颅即是侮辱了对手又是侮辱了自己

其实就是刚对藤木燃起一丝希望，以为藤木终于有了正常人的感情。结果还是不敢违背上意。让三重又一次绝望了。在真剑比武之前，三重和藤木像一对热恋情人一样。结果到最后三重明白了，藤木依然是那个藤木