肠道是免疫系统的重要组成部分，肠道发炎和食物过敏是免疫系统疾病的常见症状。
腹泻
消化系统的损伤能导致腹泻。
腹泻有时伴随疼痛及呕吐，或者呕吐物中有血或黏液，还可能导致胃口失调、行为失常或萎靡不振。根据猫发病的症状，我们能确定腹泻的原因，包括：
·食草；
·饮食过敏或过于敏感；
·食物中毒；
·寄生虫（贾第鞭毛虫）；
·病毒（肠炎，猫科白血病病毒，艾滋病）：·细菌；·药物；
·甲状腺机能亢进。
治疗方法：腹泻可根据症状来治疗。了解了诱因之后，让猫禁食几小时，但可以喝水。液体疗法对于肠炎引起的严重腹泻很有疗效。
专家建议喂给猫日常的饮食，为内脏的菌群提供与平时相似的食物。除非是细菌感染，否则不要用抗生素。
如果你的猫一直萎靡下振、发热或者便血，马上去看兽医。
肠炎
这是与免疫系统有关的疾病，发病率逐年增加。患病的通常为中年猫，经常会有习惯性呕吐、腹泻、失重和营养不良的症状。
治疗方法：兽医会让猫服用次过敏性食品，并且开一些可恢复猫免疫力的药物，像皮质类固醇。从饮食上补充营养对患肠炎的猫很有疗效。一些抗氧化物锌、硒，维生素A和E可增强免疫系统功能；生物类黄酮（维生素P），如前花色素能够和维生素C一起发挥作用增强免疫功能，并清除自由基；N-乙氨基葡萄糖也可以减轻炎症；维生素B12和维生素K以及叶酸也很有益处。
肠梗阻
造成肠梗阻最常见的原因是侵入胃肠系统的肿瘤。患病的猫可能会呕吐、腹泻、体重下降。到这个程度时，兽医很可能会摸到腹部的肿块。如果肿块没扩散，通过手术切除就可治愈。
便秘
便秘虽不常见，但如果结肠扩大并丧失其功能，就会出现严重的便秘。一般情况下，找不到结肠扩大的原因，但它有可能是由饮食、外伤以及神经肌肉疾病所引起。患病的猫会呕吐、沮丧、厌食以及排便困难。
肛门囊发炎
肛门囊发生阻塞或感染会使猫着魔似的舔它的肛门，使后腿和腹部的毛脱落。缘虫侵袭也会引起类似的问题，但程度较轻，舔的次数也相对较少。感染会导致肿胀。
治疗方法：通过兽医挤压将肛门囊肿的液体排出。如果肛门囊肿已蔓延到皮肤，产生排水脓肿，兽医会开抗生素类药品。
膨胀的腹部
过度肥胖是引起腹部膨胀最常见的原因。其他原因包括：肿瘤、腹水和器官的普遍增大。腹水是由传染性腹膜炎（见下文）或肝病引起的，是常见的疾病。器官的增大是由子宫感染、免疫系统疾病或甲状腺机能亢进引起的。如果你的猫腹部膨胀，而且你也不知道原因，应带猫去看兽医。