《理论计算化学Gaussian》、《GROMACS分子动力学》、《计算机辅助药物设计》-培训通知
本次特安排暑期系列课程,在线直播教学结合线下面对面实训
一、理论计算化学Gaussian(每个知识点均结合实例练习)
1、理论计算化学简介—初识并掌握相关量子化学基础知识,了解不同理论方法和基组
2、Gaussian及GaussView操作基础及应用—经过实际课堂任务计算,掌握程序画图和提交任务
3、Gaussian基础操作Ⅰ:—掌握文章中初级结构示意图的输出
4、Gaussian基础操作Ⅱ—各个小节进行相应的实际计算
5、Gaussian进阶操作ⅠⅡ:—各个小节进行相应的实际计算
6、7Gaussian计算专题I—反应热力学性质计算—评估反应计算—模拟文献计算方法—静电势及预测位点计算
二、GROMACS分子动力学(每个知识点均结合实例练习)
1、力场文件的建立、修改方法实践
2、各种数据分析方法实践
3、纯相、多相混合体系;界面;物理场下,混合体系、石墨烯、纳米管模拟计算
4、伞形采样——计算结合自由能
5、药物分子开发溶剂筛选
6、固/晶体建模仿真、结构变化分析
7、磷脂双分子层生物膜建模
9、学员感兴趣的相关问题
三、计算机辅助药物设计(每个知识点均结合实例练习)
1、生物分子互作基础
2、蛋白数据库、蛋白结构分析
3、同源建模、小分子构建
4、小分子化合物库
5、生物分子互作用Ⅰ分子对接软件(Autodock或薛定谔) 使用
6、虚拟筛选
7、生物分子互作用II预测蛋白-蛋白相互作用(ZDOCK或DS中的ZDOCK模块)
8、构效关系分析 3D-QSAR模型构建(Sybyl软件)
9、分子动力学模拟:Gromacs 进行分子动力学模拟-结果分析-结合自由能计算。
详情查看链接https://share.weiyun.com/YmFGgq1x 。咨询联系:康-17600400581-QQ:1608279788-微信:kang1608279788
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一、理论计算化学Gaussian(每个知识点均结合实例练习)
1、理论计算化学简介—初识并掌握相关量子化学基础知识,了解不同理论方法和基组
2、Gaussian及GaussView操作基础及应用—经过实际课堂任务计算,掌握程序画图和提交任务
3、Gaussian基础操作Ⅰ:—掌握文章中初级结构示意图的输出
4、Gaussian基础操作Ⅱ—各个小节进行相应的实际计算
5、Gaussian进阶操作ⅠⅡ:—各个小节进行相应的实际计算
6、7Gaussian计算专题I—反应热力学性质计算—评估反应计算—模拟文献计算方法—静电势及预测位点计算
二、GROMACS分子动力学(每个知识点均结合实例练习)
1、力场文件的建立、修改方法实践
2、各种数据分析方法实践
3、纯相、多相混合体系;界面;物理场下,混合体系、石墨烯、纳米管模拟计算
4、伞形采样——计算结合自由能
5、药物分子开发溶剂筛选
6、固/晶体建模仿真、结构变化分析
7、磷脂双分子层生物膜建模
9、学员感兴趣的相关问题
三、计算机辅助药物设计(每个知识点均结合实例练习)
1、生物分子互作基础
2、蛋白数据库、蛋白结构分析
3、同源建模、小分子构建
4、小分子化合物库
5、生物分子互作用Ⅰ分子对接软件(Autodock或薛定谔) 使用
6、虚拟筛选
7、生物分子互作用II预测蛋白-蛋白相互作用(ZDOCK或DS中的ZDOCK模块)
8、构效关系分析 3D-QSAR模型构建(Sybyl软件)
9、分子动力学模拟:Gromacs 进行分子动力学模拟-结果分析-结合自由能计算。
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