气功中经常提到大小周天小药大药的概念，并类比丹道，强调神通。但其在根本上就有着巨大的不同。
气功周天以热气麻胀为真炁，以外阳兴起为小药，搬运气血为周天。
丹道周天则是在内景中演化天地四时运转，日月星辰变换的过程，子午周天是一刻之中在身中演化一月的时空变化，卯酉周天是一刻之中在身中演化一年时空变化。

年月日时，久久行此三部功夫，不但入圜十月也。故曰运之一刻有一刻之周天。运之一时一日、一月一年即有一时一日、一月一年之周天也。然一刻中，上半刻为温。为进火。为望，为上弦，为朝屯，为春夏；下半刻为凉，为退符，为晦，为下弦，为暮蒙，为秋冬。一时则有上四刻、下四刻之分，即一日一月一年，皆同。此之谓攒簇阴阳五行，一刻之功夫夺一年之气候也。
——张三丰祖师《玄机直讲》