在下不才，剧情全看也不能完全明白想讲什么，只能说一下分析的结果。
首先，章节里提到过好几种结局，我来列举一番。
终末之旅。永冬结局，七实没有成为机械先哲，哈卡玛袭击空花（不一定发生），丽芙死亡，衰竭发生。
未来战争。机械教结局（建议改名机械神教），人类全灭，觉醒机械成为最后赢家，七实成为机械先哲，哈卡玛袭击空花，丽芙死亡。
我个人看来，永冬结局是七实被格式塔启发前的推演，而机械教结局是七实被启发后的第一种结局。
也就是说，永冬结局才是原本的世界线。
其中还有数个结局，空花陨落和七实单挑双子大队是IF线。
有人说最后三个没看懂，我也差不多，但我梳理后有了个大致认知。
未来七实所处的世界线应该是未来战争的变动世界线——七实回归后命令所有觉醒机械放弃作战，建造星舰进行大远征（）。毕竟联系里面的“一小撮人类”，应该指的是遭受过觉醒机械进攻的人类残余。（首席不用死了）
未来七实和七实沟通的助力是一个强大的存在，我认为是未来七实的星舰进行漫长的航行后与释放帕弥什的文明相遇，获得了时空联系的权利。至于和七实对话的“宇宙”真身，我个人倾向于是帕弥什背后文明。
而在主世界线（目前剧情），七实寻求了慈悲者的帮助，并命令哈卡玛带队撤出空花，延后了人机战争爆发，并使首席及时救下丽芙。
个人推断：原世界线中首席没有慈悲者帮助，哈卡玛袭击人类，导致丽芙死亡和战争爆发。
我觉得这次剧情挺乱的，稀里糊涂。但是看懂了会发现坑特别深。比如机械教，比如大衰竭，等等。
题外话：大衰竭造成的严寒我认为就是丽芙在升格网络中看到的未来，所以首席不是被冻死就是被砍死。海中要塞我觉得是亚特兰蒂斯，就是拉弥亚老家。（司令守国门，议长死社稷）首席拿手枪自杀（七实好感剧情），我觉得暗喻莱夫特海姆要塞被攻破时，首席自杀殉族。
七实见到的帕弥什狼和莫瑞说的被帕弥什污染的深海，或许是聚合生物发展的结果。（帕弥什大章鱼？）另外，莫瑞口中的“魔女”比安卡我很想看看到底长什么样。