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苗族医药是拥有自身理论指导的医学体系，包含了本民族的基本观念、思维方式、哲学思想、民族习惯、经验积累和特殊发现等，其总结的医药理论是指导用药的纲要。如“两纲两病理论”“苗医生成哲学”“五基成物学说”“三界九架理论”“交环理论”“四大筋脉理论”“苗药质征理论”等，无不是长期实践积累的升华和无数医学发现的结晶。