益生菌是体外培养微生物，对人体肠道而言只是访客，一般能够粘附在肠壁粘膜1-2周并发挥生理作用，之后会排出体外，并不会永久的停留在我们的肠道内。定期补充益生菌，实际上是通过饮食的方式，增加肠道有益菌的数量和比例，让有益菌与有害菌进行营养竞争，抑制有害菌，从而维持有益菌群占优势的肠道微生态平衡。
另一方面，补充进去的益生菌还对受损的肠道屏障功能有修复的作用，并调节人体的免疫功能，为身体带来持续的健康益处。
益生菌可通过参与肠道的生理活动和代谢而发挥作用，在体内的定植有明显的个体差异，同时，益生菌功效也与个体肠道中固有的生态环境、菌群组成结构和肠内营养有关。因此，吃益生菌最好在饭前半小时，温水送服，并把服用时间固定下来，每天坚持吃为好。