科目一第二次考试缴费可以在考试报名网站或者移动端进行。具体操作流程如下：1.登录驾考官网或者驾考之友APP；2.选择“科目一考试”，进入“报名缴费”页面；3.选择“科目一补考”，输入个人信息，然后选择考试时间和地点；4.选择支付方式，完成缴费。缴费方式包括支付宝、微信、银行卡等多种方式，支付成功后会生成缴费凭证。需要注意的是，考生缴费后需要按照要求及时进行考试，否则将视为自动放弃，缴费不予退还。