国家垄断资本主义的局限性在于政治体制的僵化、官僚主义的腐败、经济效率低下、创新能力不足、市场竞争不充分等问题。同时，由于国家垄断资本主义的特点是国有企业控制经济命脉，政府对经济的干预过度，因此也容易造成资源配置不合理、浪费和失调。