教育局督导室主任的主要职责是负责本地区或本单位的教育督导工作，包括组织和实施教育督导计划、开展督导工作并撰写督导报告等。同时，督导室主任还需与各级领导和相关部门进行协调和沟通，确保督导工作的顺利进行。