北京市水资源短缺的主要原因有以下几个方面：1.地理位置：北京位于华北平原的北部，地势高于周边地区，缺乏来自高山的补给水源，加上气候干旱，水资源相对匮乏。2.人口增长和城市化：随着人口的增长和城市化进程的加快，北京市的用水需求不断增加，而水资源供应难以跟上需求的增长。3.水资源开发不足：北京市的自然水资源有限，水资源的开发利用相对滞后，特别是地下水资源的过度开采，导致地下水位下降，水质变差。4.水资源污染严重：随着城市化进程的加快，工业、农业和生活污水的排放增加，导致水资源污染严重，北京市的水资源受到严重威胁。5.水资源分配不均：北京市水资源分配不均，城市和农村之间、地区之间存在水资源分配不公的问题，导致水资源的浪费和不合理使用。针对这些问题，北京市政府采取了一系列措施，如加强水资源管理和保护，推广水资源节约和循环利用技术，加强水资源的开发利用和水源地保护等，以缓解北京市水资源短缺的问题。