自动搬运单元变频器的作用是控制电机的转速和电流，通过变频器可以实现自动搬运单元的运转和停止，并且可以根据需要调整运行速度和方向，从而提高搬运效率和节约能源。此外，变频器还能保护电机和设备，延长其寿命，避免故障和损坏。