种子发芽时，通常是胚轴首先突破种皮。因为胚轴是种子的核心部位，包含了婴儿植物的主要器官和组织。而种皮是种子外部的保护层，需要胚轴具备足够的力量才能突破。此外，胚轴还需要通过吸收水分和营养物质，逐渐膨胀和生长，才能继续向外发展。因此，胚轴首先突破种皮的现象是一种自然的生理过程。