这个丧尸设定还真不够灭绝人类的，而且关于病毒和军队你犯了常识性错误。

大概率扛不住，电磁脉冲摧毁了绝大多数电子设备，丧尸病毒感染了绝大多数人，残存的电子设备普通人基本接触不到，而能接触到的人基本丧尸化了，少数幸存而刚好能动用的又因各种问题，基本丧失作用（苟住等更新局面后有用），大规模热武基本排除，普通幸存者被这两种灾难分割稀碎，无法形成有效势力，高感染率和食物（慢性感染太致命，水源食物问题太大，甚至连土地都被污染了，侥幸存活与发展起来的势力得有多少个要踩坑，特别是种花自带的种田基因，天坑，极少数有前瞻性的势力也因当下局面而有心无力，至少我个人是想不出什么办法能在这样的灾害下凑出净化大规模水源土地的物资与人力）带来的二次伤害导致生存难度提升，残存人类难以在城市内聚集反攻（短期苟住问题不大，长期太难），荒野又因食物水源问题难以解决，除非老天发善心长期不下雨，导致丧尸大规模虚弱甚至死亡，然后苟住的人进入废土副本才有一线生机，或者有天选势力一路慢慢平推（无异能的情况下，丧尸容易被物理超度，脉冲副本依旧有热武器可用）

这个时候人类文明已经事实上灭绝了，活下来的人类再繁衍的全球都是也只会诞生新文明

你干脆一颗陨石毁灭地表文明算了，何必搞这么多花里胡哨的东西。

感觉最大的问题在于土地和水源被污染，其他问题虽然头疼，倒也可以解决。
首先是93%人类丧尸化。由于事发突然加上人群聚集，第一天感染人数可能达总人口的99%。也就是说，80亿人口可能只剩下约8000万人。他们主要分布在人口稀疏的地区，如高原山地地带，远离海岸线和平原。
第二，由于丧尸病毒无法治愈，且被咬到即会感染，但是丧尸会饿死，所以最不济的方法是人自我隔离等丧尸饿死后出来重建文明。只是不知道楼主设定丧尸饿几天才会饿死。
第三，由于全球超强电磁脉冲，世界上绝大多数的电子设备遭到摧毁，楼主没说电磁脉冲到底有多强，不知道通信是否能扛住。此外，光纤通信基本不受电磁脉冲影响，所以军队通信是不会断的。
第三是食物问题。之前讲过，幸存者大多数位于人口稀疏的地区。这类地区大多数经济普遍落后，以农业生产为主，此类地区的居民都有存粮的习惯，但土地与水源污染则是致命的打击，这问题将会延续到丧尸灭绝后。不过楼主没给出具体的数据，多少水源和土地被污染，污染分布结构未给出，以及“长期摄入”是多久，均未给出。
此外，军队驻扎出会存放大量军粮，加上军队减员，所以食物和水是充足的。（水烧开不行，蒸馏行不行？）
最后是军队问题，感觉楼主低估了军队。楼主认为亲友的生死未卜会导致军心的溃散，但事实可能恰恰相反，共同的危机会把人心聚齐，危难当前，哪怕仅仅是为了自己的生存，军队的军心也不会到溃散的地步。另外，无论是抗日战争中的东北抗联，中东地区的恐怖组织，巴以冲突中的哈马斯，他们当中的作战人员大多失去了亲人，但他们也并没有丧尸军心。
因此军队不会垮掉，它最不济的后果是降格为武装组织，因为该贴的丧尸不是很强，军队被推掉的概率不是很大。
说一下最终结论吧:（军队视角）
丧尸危机爆发伊始，绝大多数人猝不及防被感染，军队、武装组织、持枪公民持有武器逃过一劫。
随后，军委通过国防光缆确定各部队状况，随后重新建制，将分散的部队汇集。
然后，军队清理丧尸，开辟出隔离区，建立据点。寻找未被污染的水源和土地，并着力进行无土栽培和水蒸馏，稳定生产。并派出队伍寻找幸存者，扩大队伍。
最后，丧尸数量日渐减少，最终消亡，人类在原据点的基础上发展，重建文明。
这是理论情况，因为楼主一些数据没给出，如果未被污染的土地和水源少得可怜，人一旦食用被污染的水和作物便会感染，丧尸的实力太强，那么人类灭亡的危险很大。
还有，人类文明早在丧尸爆发初期便早已消亡了，重建的人类文明也绝不是原先的文明了。