qRT-PCR（定量逆转录聚合酶链反应）和Western blot（蛋白质印迹法）是两种常用的生物分子检测技术，它们分别用于检测mRNA和蛋白质的表达水平。虽然蛋白质是由mRNA翻译而来，但mRNA的表达水平总是与蛋白质的表达水平一致吗？做实验任何一个结果如果你验证了几遍都是一样，那么请不要怀疑自己，也许不是你做错了，试图去解释这种现象!
蛋白表达和RNA水平不一致的原因有：
转录后调控：mRNA在转录后可以经历多种调控过程，如剪接、编辑、降解和稳定性调控。这些过程可以影响mRNA的稳定性和翻译效率。
miRNA的作用：miRNA是一类小分子RNA，它们可以与mRNA的3'非翻译区（3'UTR）结合，导致mRNA降解或抑制其翻译成蛋白质，从而降低蛋白质的表达水平。
蛋白质稳定性：蛋白质的稳定性受多种因素影响，包括蛋白质的降解速率、糖基化修饰、磷酸化等翻译后修饰。如果蛋白质的稳定性降低，即使mRNA水平较高，蛋白质水平也可能较低。
翻译效率：mRNA的翻译效率可能受到多种因素的影响，如mRNA的5'帽子结构、多聚腺苷酸尾部长度、核糖体结合位点的序列等。这些因素可以影响核糖体对mRNA的识别和结合，进而影响蛋白质的合成。
蛋白质分泌：某些蛋白质，如胞浆蛋白，可以通过胞外囊泡等途径被分泌到细胞外，这可能导致胞内蛋白质水平降低。
蛋白质合成与降解的动态平衡：蛋白质的合成和降解xi'b是一个动态平衡过程。如果蛋白质降解速率增加或合成速率降低，即使mRNA水平没有变化，蛋白质水平也可能降低。
细胞应激和环境因素：细胞在面对不同的应激条件或环境因素时，可能会调整其蛋白质合成和降解的速率，以适应环境变化。
基因表达的时空特异性：基因表达具有时空特异性，即在不同的细胞类型、组织和发育阶段，同一基因的表达水平可能不同。
实验技术的差异：qRT-PCR和Western blot是两种不同的实验技术，它们对样品的处理、检测灵敏度和特异性都有所不同，这可能导致检测结果的差异。
举例
RNA水平升高了，蛋白水平有时候降低了的原因：
1 蛋白质的表达不仅受到转录水平的调控，还受到多种转录后调控机制的影响，包括如剪接、编辑、降解和稳定性调控，这些过程可以影响mRNA和蛋白表达不一致。
2 即使mRNA水平很高，如果mRNA的翻译启动位点被序列或结构上的元素阻塞，或者存在影响翻译的调控因子，翻译效率也可能降低，最终蛋白质表达水平降低。
3 蛋白质的半衰期在不同条件下也会显著性变化，一些蛋白质在特定信号下可能会更快地降解，即使mRNA水平很高。
4 细胞内的一些反馈机制可能通过降低特定蛋白质的稳定性或翻译效率来响应mRNA水平的升高，以此来维持细胞内环境的稳定。