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其中的枯草杆菌纤溶酶与交联纤维蛋白具有更强的亲和性，可以通过特异性直接溶解血栓中交联纤维蛋白，瓦解血栓；可以激活组织型纤溶酶原激活剂，间接发挥溶栓功效；也可以激活尿激酶原转化为尿激酶，间接发挥溶栓功效；还可以抑制纤溶酶原激活剂抑制剂，激发纤溶系统，从而达到瓦解血栓的作用，并且枯草杆菌纤溶酶溶栓功效显著强于体内自身的纤溶酶。枯草杆菌纤溶酶还可以通过抑制血小板的聚集，降低血液中纤维蛋白原、凝血因子 VI 和 VШ 的积累，从而达到预防血栓形成的功效。