宝宝嗓子起疱主要与以下疾病有关系：
1、疱疹性咽峡炎，这是由于病毒感染导致，有时会合并细菌感染，查血常规可以见到白细胞增高、中性粒细胞增高，这种情况可以给予抗生素进行治疗，喉咙可以给予开喉剑喷雾剂或者康复新液进行局部的对症治疗，还可以口服胆木浸膏糖浆、复方鱼腥草合剂等进行清热解毒治疗。
2、属于手足口病的一种临床表现，除了咽喉部疱疹以外，在宝宝的手心、脚心、膝关节，以及臀部等部位也会看到疱疹，这种情况也属于病毒感染，给予对症治疗就可以。还要注意观察宝宝的精神状态，如果合并心肌炎、肺炎以及脑膜炎等并发症，需要住院观察治疗。