黑暗时代，先天神王分为两个派系，激进派以大司命为首，企图统治所有后天生灵，以后天生灵作为奴隶、血食，保持神王们的稳固统治。
另一派是以雷泽神王（先天神龙）与华胥娘娘（先天大蛇）为首的温和派，认为后天生灵为先天神王的子嗣，不应残酷统治。
后来雷泽与华胥生下大燧，大燧开创图腾修炼体系，使得后天生灵能够修炼，逐渐强大，后与先天神王形成分庭抗礼之势，先天神王不再无敌。惊怒于后天生灵的强大力量，也为保持其统治地位，激进派先天神王与后天生灵开战，宇宙生灵涂炭。
大司命见后天生灵崛起之势不可阻挡，于是集合手下神王所有力量，企图开辟道界，成为道神，以图永久性统治天下，但开辟道界失败，大司命与手下诸多嫡系神王身死镇天府。其余先天神王仍旧对后天生灵实行高压统治，战争愈演愈烈。
大燧以后天修炼的强大力量平息神王之乱，诸多神王死的死藏的藏，渐渐销声匿迹。黑暗时代被终结。大燧创造了薪火，可以传承文明，功法。他开辟了虚空界，使得灵魂能保持不灭，并且开创了火纪时代，大燧也因此成为第一代天皇天帝。
但神王们并不死心，他们为天地所生，与天同寿，生来就无比强大，但同时先天大道也禁锢了他们，他们无法像后天生灵那样修炼发展壮大。后天生灵虽然强大，但有寿元限制，最强大的天帝也只能活五万年。后来他们发现，吞食掉强大的后天生灵会得到他们的道，会学会新的神通道法， 会让他们更加强大。为了变得更强，也为了重新回到太古神王统治时代，一场场“捕鱼行动”开始了。后来神王们又掀起了一场场的动乱，吞噬了更多的后天高手，他们的力量也在逐渐变强。
四十万年后，一场浩大的战争席卷宇宙。火纪时代被终结，进入“小黑暗时代”，太古神王的残酷统治又开始了。大燧的后代算兹氏遗族率领后天生灵激烈反抗，时间持续三十万年，异兹氏在混乱年代中也被灭族。舁兹氏后代庖牺氏得到薪火传承，开始崛起，征战神王。庖牺氏与妻子华胥氏女娲娘娘的帝击之术龙蛇合击冠绝当世，将诸多作乱的太古神王杀的杀镇压的镇压，结束小黑暗时代，并开创地纪时代，庖牺氏(也称伏羲)成为第一代地皇天帝。
伏羲氏人首蛇身，生有三眼，内藏日月太极，上天庭，下视九幽，看破虚妄，传承于华胥氏，蛇尾日为先天龙鳞，能够映照神通破绽，传承于雷泽氏。伏羲氏种族血脉之力无比强大，其族人在血脉限制内就能成就大帝道果。地纪时代历经七十二朝地皇天帝，其中伏羲氏地皇就有二十三朝。也因伏羲氏太过强大，神王们深知伏羲氏的恐怖之处，伏羲一日不灭，神王一日不能出头。于是在伏羲氏第九朝天帝羲昊帝在位时，先天黑帝与落日神王定下计策，欲灭伏羲，先灭薪火，伏羲氏传承断绝之后，种族功法无法完整的传承给下一代，威胁会逐渐降低。于是落日神王派其弟波旬挑战这一代的薪火传承者，波旬被杀，而年老的传承者也中了落日神王的神通，于祖星中陷入沉眠，直至坐化，薪火也因此沉睡七十三万年。
薪火消失后，伏羲氏仍旧十分强大，为宇宙最强种族之一。到了第二十三朝伏羲地皇伏旻道尊时期，伏羲氏进入鼎盛阶段。伏旻道尊实力极其强大，为史上最强天帝，他开辟六道轮回，将帝级高手的寿命提升至十二万年，在他的时代，道法神通得到极大发展。道尊率领麾下其他大帝将太古神王打的极其凄惨，他的力量之强大使得道神都不敢轻易下界作乱，以一己之力镇压了整整个时代。 以至于后来主角钟岳后来化作伏旻道尊的样貌征战神王时，不少神王吓得肝胆俱裂，由此可见道尊余威。
然而道尊终究是后天生灵，免不了生老病死。道尊晚年时察觉到太古神王的‘捕鱼计划”，于是将计就计，挑起神魔之战，伏旻道尊率军进行残酷镇压，一举斩杀三千大帝，将他们的元神秘境练成三千六道界。神王们的计策落空，辛苦养大的“鱼”就这样被道尊釜底抽薪。
道尊终于年迈，即将走到生命的尽头。他察觉到，一个强大祭祀先天神“天”诞生了。而此时他的儿子启明皇太子发现了父亲竟然是挑起神魔之乱的幕后黑手，皇太子悲愤交加，认为父亲年老昏聩，这么做是想家天下。道尊深知自己的儿子虽然实力强大，仁慈聪慧，但却懦弱无能，一旦此事被他公之于众，伏羲神族必将被天 下万族群起而攻之，“天” 和太古神王们也会因此下手，伏羲神族有灭族之虞。然而他现在寿元已尽，无法继续为伏羲神族除去这些威胁，他看到了伏羲的将来，但已无力回天，只得抱憾魂归虛空界。
道尊死后，启明皇太子将道尊所作所为告知天下，并低头道歉。天下哗然，同时也看到了这位伏羲领袖的软弱，伏旻道尊为伏羲神族树立十二万年的无敌形象就这样毁于一旦。
伏旻道尊的灵柩被送回祖星安葬。送葬者皆为伏羲精锐，但在路上遭遇先天黑帝伏击，伏羲神族的中坚力量几乎被一网打尽，千年积累下来的天才高手几乎死绝，由此伏羲神族出现了一个长达千年的高手断层。伏旻道尊的帝灵下界，入主肉身大战黑帝，适逢主角钟岳破开第二重血脉封印带着薪火回到十万年前，道尊借薪火之力重创黑帝，而自己也魂飞魄散。