福州大学马克思主义学院筹建于2009年10月，2011年4月正式成为独立的、直属于学校领导的教学科研二级机构，其前身为1958年福州大学建校时的马列主义教研室。学院现为福建省委教育工委重点马克思主义学院资助单位。学院现有政治经济学二级学科博士点（与经济管理学院共建共享），学院马克思主义理论学科入选福建省一流学科建设项目（高原学科），马克思主义理论一级学科博士点入选学校新增博士点专项培育计划。